Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CCDC180Q9P1Z9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CCDC180Q9P1Z9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCDC180Q9P1Z9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms