Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms