Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHD2Q9NZN4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms