Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EHD3Q9NZN3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms