Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RRN3Q9NYV6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RRN3Q9NYV6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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