Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK12Q9NYV4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK12Q9NYV4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms