Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR4Q9NYA4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms