Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2AIPQ9NXV6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms