Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC4Q9NTJ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC4Q9NTJ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms