Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG3Q9NT62 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG3Q9NT62 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms