Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTPS2Q9NRF8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTPS2Q9NRF8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms