Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH2B1Q9NRF2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms