Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms