Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRC4Q9NPP4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms