Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLMQ9NP87 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLMQ9NP87 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms