Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC17Q9NP64 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms