Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms