Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRA1Q9HD15 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRA1Q9HD15 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms