Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX8Q9HC52 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms