Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF2Q9HAU5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms