Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRDE2Q9H7Z3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms