Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF41Q9H4P4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms