Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNMDQ9H2S6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNMDQ9H2S6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms