Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM49AQ9H0Q0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM49AQ9H0Q0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms