Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms