Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2J2Q9GZM3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2J2Q9GZM3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms