Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER1Q9C0I3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms