Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms