Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC2Q9BYS8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms