Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms