Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms