Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFHD1Q9BUP0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHD1Q9BUP0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms