Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKNK1Q9BUB5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MKNK1Q9BUB5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms