Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNPY3Q9BT09 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNPY3Q9BT09 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms