Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDHD3Q9BSH5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms