Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGMATQ9BSE5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGMATQ9BSE5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms