Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms