Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms