Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VGLL1Q99990 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms