Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF15Q99988 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF15Q99988 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms