Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPA33Q99795 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms