Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NAP1L3Q99457 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms