Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF1Q96T88 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF1Q96T88 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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