Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SIN3AQ96ST3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SIN3AQ96ST3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms