Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACCSQ96QU6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms