Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms