Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCEEQ96PE7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCEEQ96PE7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms