Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNDC3BQ96NL0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms