Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC17Q96LX7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms