Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP8Q96LD8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP8Q96LD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms